Письмо ФНС России от 05.10.2016 N СД-4-3/18862@

ФНС согласилась с ВАС: если в договоре нет условия об НДС, налог включен в цену.
Из договора или обстоятельств, связанных с его заключением, не всегда бывает ясно, включен ли НДС в цену. Если невозможно сделать вывод, что цена указана без учета налога, продавец определяет его расчетным методом. В этом случае нельзя предъявлять покупателю НДС сверх цены. Так считал Пленум ВАС. Теперь к такому выводу пришла и ФНС: когда из обстоятельств или договора следует, что НДС не включен в цену, продавец предъявляет налог дополнительно.