Письмо ФНС РФ от 28.09.16 № ЗН-4-1/18184@ об уплате налогов с расчетного счета.

Юридическими лицами уплата налогов и сборов в бюджетную систему РФ должна производиться в безналичной форме путем предъявления в банк поручения на уплату налога с расчетного (текущего) счета организации.
Денежные средства, уплаченные физ.лицом за ЮЛ, не могут быть отражены налоговым органом в счет уплаты налоговых платежей организации, в том числе задолженности по ним.